На втором этапе реформ, когда первоочередными задачами становятся обеспечение экономической стабилизации и структурных преобразований, налоговая система должна преимущественно выполнять свою стимулирующую функцию. Это потребовало существенного реформирования всей действующей налоговой системы.
Главный принцип, который был положен в основу изменения налоговой системы — это резкое снижение налогового бремени на предприятия. Высокая ставка налога на доход лишала предприятия возможности направлять средства на развитие собственного производства, техническое переоснащение, пополнение собственных оборотных средств, что в конечном итоге повлияло на спад производства. Более того, при длительном сохранении высокого налогового бремени возникает опасность косвенной поддержки высокого уровня инфляции. Это вызвано тем, что при спаде производства наращивание налоговой массы может произойти только в результате инфляционного роста доходов предприятия. А это уже граничит с развалом финансовой системы, со стагнацией производства., обострением социальных проблем.
Переход с налогообложения доходов к изъятию налогов с прибыли при снижении налогового бремени открывает возможность активизации производственной и предпринимательской деятельности. Возрастание массы прибыли, остающейся в распоряжении предприятий, не только укрепит их финансовое положение, но и приведет к оживлению их инвестиционной деятельности, что будет служить производственной и технологической основой для структурных преобразований.
Предоставление большей экономической свободы предприятиям должно привести не только к увеличению общей массы прибыли, направляемой на расширенное воспроизводство, но и одновременно открывает возможность увеличить заработки трудящихся. Формируется экономическая среда, стимулирующая активную трудовую деятельность, позволяющая каждому человеку реализовать свой потенциал и в меру своего участия получать соответствующий доход. В этих условиях налоги с физических лиц должны, с одной стороны, заинтересовывать работников своим трудом активно участвовать в общественном производстве, с другой стороны, содействовать тому, чтобы уровень заработка был адекватен вложенному труду, не приводил к необоснованной сильной дифференциации в доходах трудящихся.